Можно ли выполнять подсчет и анализ клиент-серверных вызовов с помощью замера производительности в конфигураторе?

Да, но нужно учитывать, что этот режим показывает только вызовы, которые выполняются непосредственно в ходе выполнения модулей и не показывает вызовы, которые выполняются платформой вне выполнения модулей.